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办理农村合作社需要的手续如下：
1、第一步：申领合作社法人营业执照；
2、第二步：办理合作社公章；
3、第三步：农经办办理登记（农业局下属农经办）；
4、第四步：申领组织机构统一代码证；
5、第五步：申领税务登记证；
6、第六步：办理银行开户和账号。
农村合作社有以下好处：
1、合作社销售成员的产品视同农户自产自销；
2、增值税一般纳税人从合作社购买产品可以按照13%进行进项税抵扣；
3、合作社向成员提供农资免征增值税；
4、合作社与成员签定的产品销售合同，免征印花税；
5、在项目方面，合作社可作为涉农项目主体单位；
6、各地每年都安排一定数量的财政扶持资金；
7、在金融支持方面，合作社纳入信用评价体系之中，给予先评级后授信再用信的办法解决合作社贷款难问题，可以更容易获得贷款基金扶持。
法律依据
《中华人民共和国农民专业合作社法》
第十六条 设立农民专业合作社，应当向工商行政管理部门提交下列文件，申请设立登记：
（一）登记申请书；
（二）全体设立人签名、盖章的设立大会纪要；
（三）全体设立人签名、盖章的章程；
（四）法定代表人、理事的任职文件及身份证明；
（五）出资成员签名、盖章的出资清单；
（六）住所使用证明；
（七）法律、行政法规规定的其他文件。
登记机关应当自受理登记申请之日起二十日内办理完毕，向符合登记条件的申请者颁发营业执照，登记类型为农民专业合作社。
农民专业合作社法定登记事项变更的，应当申请变更登记。
登记机关应当将农民专业合作社的登记信息通报同级农业等有关部门。
农民专业合作社登记办法由国务院规定。办理登记不得收取费用。
注册农民专业合作社要有2个条件，第一条是有5名以上村民才能够申请，并且农民至少应当占成员总数的百分之八十。第二条合作社成员是具有民事行为能力的公民。简单的讲，就是5名以上村民提供身份证、户口簿，通过工商程序就可以申请合作社。农民专业合作社的成员中，农民至少应当占成员总数的百分之八十。成员总数二十人以下的，可以有一个企业、事业单位或者社会团体成员；成员总数超过二十人的，企业、事业单位和社会团体成员不得超过成员总数的百分之五。
如今的社会，空壳社很多，国家也在大力度整改当中，所以在注册合作社的时候也要重视起来，合作社也是有法人的，作为新型经营主体也需要承担民事责任，在注册的时候到当地工商部门取登记申请书，进行设立登记，要设立大会纪要，明确合作社经营的范围，还要明确出资成员的出资比例，制定合作社章程。
工商登记完成后，当时就会打印营业执照，在去税务局办理税务登记证，之后到银行办理对公账号就可以了。现在最好到政务大厅，将一些申请书和告知书带回来就明白怎么申请了。
农村合作社作用
1，桥梁。
2，重要组织形式。
3，有效渠道农民专业合作社作为代表和维护社员权益的组织，能及时向政府及有关部门反映行业的要求、建议和意见，积极争取相关政策。
法律依据
《中华人民共和国农民专业合作社法》
第四条 农民专业合作社应当遵循下列原则：
（一）成员以农民为主体；
（二）以服务成员为宗旨，谋求全体成员的共同利益；
（三）入社自愿、退社自由；
（四）成员地位平等，实行民主管理；
（五）盈余主要按照成员与农民专业合作社的交易量（额）比例返还。第七条 国家保障农民专业合作社享有与其他市场主体平等的法律地位。
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